A política e as linhas gerais de atuação da instituição são definidas pelo Conselho Superior, cabendo sua implementação ao Conselho Técnico-Administrativo. O Conselho Superior é formado por 12 membros, nomeados pelo Governo do Estado, tendo como característica básica, currículo comprovado de atuação na área científica e tecnológica.

Composição do Conselho Superior

Presidente do Conselho:  Ednei Gilberto Primel (FURG)

Vice Presidente do Conselho: Márcia Foster Mesko (UFPel)

Conselheiros:

Aderbal Fernandes Lima (FIERGS)

Afonso Luís Barth (HCPA)

Andréia Rosane de Moura Valim (UNISC)

Elizabeth Obino Cirne-Lima (SEAPI)

Érico Marlon de Moraes Flores (UFSM)

Luiz Carlos Pinto da Silva Filho (Secretaria de Inovação de Porto Alegre)

Márcia Rodrigues dos Santos Capellari (ATITUS EDUCAÇÃO)

Maria Martha Campos (PUCRS)

Pâmela Billig Mello-Carpes (Unipampa)

Poli Mara Spritzer (UFRGS)