A política e as linhas gerais de atuação da instituição são definidas pelo Conselho Superior, cabendo sua implementação ao Conselho Técnico-Administrativo. O Conselho Superior é formado por 12 membros, nomeados pelo Governo do Estado, tendo como característica básica curriculum comprovado de atuação na área científica e tecnológica.

Composição do Conselho Superior

Presidente do Conselho: Pedro Gilberto Gomes (UNISINOS)

Vice Presidente do Conselho: Renato Zanella (UFSM)

Conselheiros:

Afonso Luís Barth (HCPA)

Carla Denise Bonan (PUCRS)

César Valmor Rombaldi (UFPel)

Daniel Martin Ely (Randon)

Ednei Gilberto Primel (FURG)

Luiz Carlos Illafont Coronel (Secretaria da Saúde/RS)

Luiz Carlos Pinto da Silva Filho (UFRGS)

Newton Mario Battastini (FIERGS)

Pâmela Billig Mello-Carpes (UNIPAMPA)

Simone Stülp (UNIVATES)