A Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul- FAPERGS foi a segunda a ser criada no país. 

O Conselho Nacional das FAP's - CONFAP foi criado em 2007 e atualmente congrega 26 Fundações.

FAPESP (SÃO PAULO) - 23/05/1962
FAPERGS (RIO GRANDE DO SUL) - 31/12/1964
FAPERJ (RIO DE JANEIRO) - 16/06/1980
FAPEMIG (MINAS GERAIS) - 20/05/1986
FACEPE (PERNAMBUCO) - 26/12/1989
FAPEAL (ALAGOAS) - 27/09/1990
FUNCAP (CEARÁ) - 12/11/1990
FAPESQ (PARAÍBA) - 06/07/1992
FAPDF ( DISTRITO FEDERAL) - 04/11/1992
FAPEPI (PIAUÍ) - 20/12/1993
FAPEMAT (MATO GROSSO) - 21/12/1994
FAPESC (SANTA CATARINA) - 09/01/1997
FUNDECT (MATO GROSSO DO SUL) - 03/07/1998
FUNDAÇÃO ARUCÁRIA (PARANÁ) - 06/01/2000
FAPESB (BAHIA) - 27/08/2001
FAPEMA (MARANHÃO) - 31/01/2003
FAPEAM (AMAZONAS) - 21/05/2003
FAPERN (RIO GRANDE DO NORTE) - 19/04/2004
FAPES (ESPIRÍTO SANTO) - 23/06/2004
FAPITEC (SERGIPE) - 12/12/2005
FAPEG (GOIÁS) - 12/12/2005
FAPESPA (PARÁ) - 24/07/2007
FAPEAP (AMAPÁ) - 30/12/2009
FAPT (TOCANTINS) - 31/03/2011
FAPERO (RONDÔNIA) - 25/07/2011
FAPAC (ACRE) - 17/02/2012